Stasiun Ceper (CE) adalah stasiun kereta api kelas II yang terletak di Klepu, Ceper, Klaten; pada ketinggian +133 meter, termasuk dalam Daerah Operasi VI Yogyakarta.
Ke arah barat stasiun ini, sebelum Stasiun Klaten, terdapat Stasiun Ketandan yang sudah tidak aktif sejak jalur ganda lintas Kutoarjo–Solo beroperasi. Selain itu, dari stasiun ini terdapat percabangan jalur ke Pabrik Gula Ceper Baru yang kini telah dinonaktifkan.
Sejak 10 Februari 2021, bertepatan dengan peluncuran grafik perjalanan kereta api tahun 2021, stasiun ini bersama dengan tiga stasiun lain (Stasiun Delanggu, Stasiun Gawok, dan Stasiun Srowot) mulai melayani penumpang KRL lintas Yogyakarta–Solo Balapan.